مشخصات پژوهش

عنوان	تعیین ژنوتیپ تمام قطعات ژنومی دو روتاویروس A گاوی G10P[11] ردیابی شده در مطالعات گذشته در ایران
نوع پژوهش	طرح پژوهشی خاتمه‌یافته
کلیدواژه‌ها	روتاویروس A گاو، اسهال، تعیین توالی کامل، تعیین ژنوتیپ کامل، RNA-seq NGS
چکیده	روتاویروس ها به عنوان مهمترین عامل ویروسی ایجاد اسهال در نوزاد انسان و بسیاری از حیوانات به خصوص گاو شناخته می شوند. این ویروس های گوارشی پراکندگی جهانی دارند و در تمام دنیا معضلی برای صنعت گاوداری محسوب می شوند. ژنوم آن ها 11 قطعه RNA دو رشته ای است که هنگام تکثیر در سلول میزبان ممکن است پدیده نوترتیبی را پشت سربگذارد. بنابراین تعیین ژنوتیپ تمام قطعات ژنتیکی این ویروس اهمیت بسیاری برای شناخت ایپدمیولوژی جمعیت های روتاویروسی در حال گردش در یک منطقه دارد. تحقیقات نشان داده که ژنوتیپ G10P[11] رایج ترین ژنوتیپ گاوی در ایران است. در این مطالعه 5 نمونه مدفوع از گوساله های مبتلا به اسهال که پیش از این تعیین ژنوتیپ شده بودند از استان های فارس (2 نمونه)، اراک، تهران و زنجان انتخاب شدند و با استفاده از روش NGS (توالی یابی نسل بعد) به طور کامل تعیین توالی شدند. تعیین توالی نمونه های فارس و اراک به طور کامل انجام شد. نمونه زنجان کاملا تعیین توالی نشد. تعیین توالی نمونه تهران شکست خورد. توالی های مربوطه در بانک جهانی ژن به ثبت رسید. نتایج نشان دهنده وقوع نوترتیبی بسیار شدید در ژنوتیپ G10P[11] روتاویروس گاوی در ایران دارد. بررسی نوترکیبی با نرم افزار RBP4 شواهد معتبری از وقوع نوترکیبی را نشان نداد. این مطالعه اولین تلاش برای تعیین توالی تمام ژنوم روتاویروس گاوی (و سایر روتاویروس ها حتی انسانی) در ایران است و برای ساخت واکسن روتاویروس با سویه های ایرانی یک گام به جلو محسوب می شود.
پژوهشگران	احمد نازک تبار (نفر اول)