|
Title
|
تعيين ژنوتيپ تمام قطعات ژنومي دو روتاويروس A گاوي G10P[11] رديابي شده در مطالعات گذشته در ايران
|
|
Type
|
FinishedProject
|
|
Keywords
|
روتاويروس A گاو، اسهال، تعيين توالي كامل، تعيين ژنوتيپ كامل، RNA-seq NGS
|
|
Abstract
|
روتاويروس ها به عنوان مهمترين عامل ويروسي ايجاد اسهال در نوزاد انسان و بسياري از حيوانات به خصوص گاو شناخته مي شوند. اين ويروس هاي گوارشي پراكندگي جهاني دارند و در تمام دنيا معضلي براي صنعت گاوداري محسوب مي شوند. ژنوم آن ها 11 قطعه RNA دو رشته اي است كه هنگام تكثير در سلول ميزبان ممكن است پديده نوترتيبي را پشت سربگذارد. بنابراين تعيين ژنوتيپ تمام قطعات ژنتيكي اين ويروس اهميت بسياري براي شناخت ايپدميولوژي جمعيت هاي روتاويروسي در حال گردش در يك منطقه دارد. تحقيقات نشان داده كه ژنوتيپ G10P[11] رايج ترين ژنوتيپ گاوي در ايران است. در اين مطالعه 5 نمونه مدفوع از گوساله هاي مبتلا به اسهال كه پيش از اين تعيين ژنوتيپ شده بودند از استان هاي فارس (2 نمونه)، اراك، تهران و زنجان انتخاب شدند و با استفاده از روش NGS (توالي يابي نسل بعد) به طور كامل تعيين توالي شدند. تعيين توالي نمونه هاي فارس و اراك به طور كامل انجام شد. نمونه زنجان كاملا تعيين توالي نشد. تعيين توالي نمونه تهران شكست خورد. توالي هاي مربوطه در بانك جهاني ژن به ثبت رسيد. نتايج نشان دهنده وقوع نوترتيبي بسيار شديد در ژنوتيپ G10P[11] روتاويروس گاوي در ايران دارد. بررسي نوتركيبي با نرم افزار RBP4 شواهد معتبري از وقوع نوتركيبي را نشان نداد. اين مطالعه اولين تلاش براي تعيين توالي تمام ژنوم روتاويروس گاوي (و ساير روتاويروس ها حتي انساني) در ايران است و براي ساخت واكسن روتاويروس با سويه هاي ايراني يك گام به جلو محسوب مي شود.
|
|
Researchers
|
ahmad nazaktabar (First researcher)
|