مشخصات پژوهش

عنوان	طراحی بیوانفورماتیکی یک پروتئین چنداپی توپی جدید جهت کاربرد در توسعه روش تشخیص باکتری Mycoplasma agalactiae
نوع پژوهش	طرح پژوهشی خاتمه‌یافته
کلیدواژه‌ها	بیوانفورماتیک، اپی توپ، آنتی ژن، Mycoplasma agalactiae، تست تشخیصی
چکیده	با پیشرفت ابزارهای بیوانفورماتیکی در تحلیل و آنالیز ماکرومولکول ها و همچنین دسترسی به ژنوم کامل باکتری Mycoplasma agalactiae امکان طراحی سازه های جدید جهت استفاده در روش های تشخیص و تولید واکسن علیه این باکتری فراهم گردیده است. در این مطالعه با استفاده از ابزارهای متعدد بیوانفورماتیکی، یک پروتئین چنداپی توپی کاربردی در توسعه روش تشخیص آلودگی ناشی از باکتری Mycoplasma agalactiae طراحی و جهت انجام مراحل تجربی پیشنهاد گردید. بدین منظور، با استفاده از سرورهای آنلاین مختلف، ORFهای مربوط به کل پروتئین هایOuter membrane و Exteracellular باکتری که در معرض سیستم ایمنی میزبان می باشند تعیین گردید. پس از انجام آنالیزهای متعدد، اپی توپ های B-cell که غیرتوکسیک، غیرآلرژن، دارای اختصاصیت برای باکتری و با قدرت آنتی ژنی بالا بودند انتخاب شده و با استفاده از لینکر KK به هم متصل شدند. پروتئین چنداپی توپی حاصل، از نظر خصوصیات فیزیکوشیمیایی، ساختار دوم و برهم کنش با سلول های ایمنی میزبان مورد بررسی قرار گرفت. از یافته های این مطالعه می توان نتیجه گرفت که پروتئین چنداپی توپی طراحی شده ی حاصل، پایدار، دارای خاصیت آنتی ژنی بالا، قادر به برهم کنش مطلوب با سلول های ایمنی بدن میزبان بوده و جهت سنتز و انجام مطالعات تجربی مناسب می باشد.
پژوهشگران	ملیحه اکبرزاده نیاکی (نفر اول)، مجتبی رنجبر (همکار)