مشخصات پژوهش

عنوان	ارتباط شبکه ها ی پروتئینی و ژنی SOX2 در فرآیند خودنوزایی و تمایز سلول های عصبی با استفاده از آنالیز های بیوانفورماتیکی
نوع پژوهش	مقاله ارائه‌شده
کلیدواژه‌ها	, sox2 نوروژنز , سلول بنیادین عصبی , پروتئین-پروتئین , فاکتور رونویسی
چکیده	Sox2 یکی از اعضای فاکتور رونویسی SoxB1 ، تنظیم کننده رونویسی مهم در سلول های بنیادی عصب است. آنها به همراه فاکتور رونویسی نانوگ که به اکتامر متصل می شوند، بیان ژن را در سلول های بنیادی عصب به طور مشترک کنترل می کنند و پرتوان بودن خود را حفظ می کنند. علاوه بر این، Sox2 نقش اساسی در برنامه ریزی مجدد سلول های عصبی ایفا می کند و پیکربندی اپی ژنتیکی سلول های تمایز یافته را به حالت جنینی پرتوان برمی گرداند. Sox2 علاوه بر نقش خود در تنظیم پرتوان، عامل مهمی برای هدایت تمایز سلول های بنیادی عصب و حفظ خواص سلول های بنیادی پیش ساز عصبی است. SOX2 در حال بررسی نقش های اساسی در مسیرهای مختلف پیام رسانی و پیشرفت در سلول های بنیادی عصبی است. با توجه به نوروژنز و شبکه تمایز سلول های بنیادی عصبی، این مقاله روش استخراج تعامل پروتئین-پروتئین ) PPI ( را پیشنهاد می کند. مدل ما بر ابزارهای بیوانفورماتیک تکیه می کند. ما از مدل های استخراج PPI به شدت برای تکیه زیاد بر تجزیه نتایج حاصل از ابزارهای پردازش زبان طبیعی مانند زبان R استفاده می کنیم. ما مدل خود را بر اساس پنج ژن اصلی KLF4 ، OTX2 ، CD24 ، FGF2 و HDAC2 در تمایز سلول های بنیادی عصبی ارزیابی کردیم و BMI1 ، PAX3 ، EZH2 ، GFAP ، ZIC1 و MYCN با SOX2 در نوروژنز همکاری بالایی دارند. این مطالعات نقش اساسی SOX2 را در نوروژنز و تمایز سلول های بنیادی عصبی نشان می دهد و اهمیت آن را در فعالیتهای NPC که برای رشد ، رشد و بهبود مغز از آسیب بسیار مهم است ، تأیید می کند.
پژوهشگران	سید دانیال هاشمی کروئی (نفر اول)، حسین عزیزی (نفر دوم)