|
Title
|
ارتباط شبكه ها ي پروتئيني و ژني SOX2 در فرآيند خودنوزايي و تمايز سلول هاي عصبي با استفاده از آناليز هاي بيوانفورماتيكي
|
|
Type
|
Presentation
|
|
Keywords
|
, sox2 نوروژنز , سلول بنيادين عصبي , پروتئين-پروتئين , فاكتور رونويسي
|
|
Abstract
|
Sox2 يكي از اعضاي فاكتور رونويسي SoxB1 ، تنظيم كننده رونويسي مهم در سلول هاي بنيادي عصب است. آنها به همراه فاكتور
رونويسي نانوگ كه به اكتامر متصل مي شوند، بيان ژن را در سلول هاي بنيادي عصب به طور مشترك كنترل مي كنند و پرتوان
بودن خود را حفظ مي كنند. علاوه بر اين، Sox2 نقش اساسي در برنامه ريزي مجدد سلول هاي عصبي ايفا مي كند و پيكربندي
اپي ژنتيكي سلول هاي تمايز يافته را به حالت جنيني پرتوان برمي گرداند. Sox2 علاوه بر نقش خود در تنظيم پرتوان، عامل مهمي
براي هدايت تمايز سلول هاي بنيادي عصب و حفظ خواص سلول هاي بنيادي پيش ساز عصبي است.
SOX2 در حال بررسي نقش هاي اساسي در مسيرهاي مختلف پيام رساني و پيشرفت در سلول هاي بنيادي عصبي است. با توجه
به نوروژنز و شبكه تمايز سلول هاي بنيادي عصبي، اين مقاله روش استخراج تعامل پروتئين-پروتئين ) PPI ( را پيشنهاد مي كند.
مدل ما بر ابزارهاي بيوانفورماتيك تكيه مي كند. ما از مدل هاي استخراج PPI به شدت براي تكيه زياد بر تجزيه نتايج حاصل از
ابزارهاي پردازش زبان طبيعي مانند زبان R استفاده مي كنيم. ما مدل خود را بر اساس پنج ژن اصلي KLF4 ، OTX2 ، CD24
، FGF2 و HDAC2 در تمايز سلول هاي بنيادي عصبي ارزيابي كرديم و BMI1 ، PAX3 ، EZH2 ، GFAP ، ZIC1 و
MYCN با SOX2 در نوروژنز همكاري بالايي دارند. اين مطالعات نقش اساسي SOX2 را در نوروژنز و تمايز سلول هاي بنيادي
عصبي نشان مي دهد و اهميت آن را در فعاليتهاي NPC كه براي رشد ، رشد و بهبود مغز از آسيب بسيار مهم است ، تأييد مي كند.
|
|
Researchers
|
danial hashemi (First researcher) , hossein azizi (Second researcher)
|