مشخصات پژوهش

عنوان	بررسی پروفایل پروتئین های مایکوپلاسماهای تناسلی به منظور طراحی کاندید واکسن برای پیشگیری از عفونت های مرتبط
نوع پژوهش	طرح پژوهشی خاتمه‌یافته
کلیدواژه‌ها	بیوانفورماتیک، اپی توپ، واکسن،Mycoplasma genitalium ،Mycoplasma hominis
چکیده	باکتری هایMycoplasma genitalium وMycoplasma hominis از جمله پاتوژن های مهم دستگاه تناسلی انسان هستند که نقش مهمی در ایجاد ناباروری ایفا می کنند. هدف از انجام این پژوهش، طراحی یک واکسن دوگانه شامل اپی توپ های هر دو پاتوژن فوق و ارزیابی خواص فیزیکوشیمیایی و پتانسیل واکسن در تهییج سلول های سیستم ایمنی میزبان بود. با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی متعدد، پس از انتخاب پروتئین های سطح سلولی دو باکتری، اپی توپ های سلول های B و T مربوط به هر پروتئین تخمین زده شد. سپس اپی توپ های اختصاصی، غیر سمی، غیرآلرژن و دارای خاصیت آنتی ژنی بالا شناسایی و جهت ساخت واکسن انتخاب شد. لینکرهای AAY، GPGPGو KK جهت اتصال اپی توپ های منتخب و لینکر EAAK جهت اضافه نمودن ادجوانت ایمنی زای بتادفنسین به ساختار نهایی واکسن مورد استفاده قرار گرفت. سپس ویژگی های ساختاری واکسن طراحی شده، از جمله ساختار دوم و سوم، قطبیت، حلالیت و داکینگ مولکولی با گیرنده های سیستم ایمنی میزبان ارزیابی شد. بر اساس داده های حاصل از تحلیل ساختار دوم واکسن طراحی شده، درصد حضور پیچ ، صفحات و مارپیچ آلفا حاکی از پایداری و پتانسیل مناسب پروتئین در تشکیل اپی توپ بوده و همچنین بررسی ساختار سه بعدی آن، قطبیت و حلالیت مطلوب پروتئین واکسن را تایید نمود. نتایج حاصل از انجام داکینگ مولکولی، قابلیت بالای این واکسن را در برهم کنش با گیرنده های سلول های سیستم ایمنی میزبان نشان داد. واکسن دوگانه چند اپی توپی طراحی شده در این مطالعه، پایداری مطلوب و پتانسیل بالایی در تحریک پاسخ سیستم ایمنی میزبان داشته و می تواند جهت توسعه واکسن های هدفمند علیه این پاتوژن ها مورد استفاده قرار گیرد.
پژوهشگران	ملیحه اکبرزاده نیاکی (نفر اول)